Empyrean Age maakt een einde aan het vredesverdrag dat tot nu toe in stand werd gehouden en spelers zullen dus tussen de vier verschillende facties in het spel moeten kiezen. Nieuw in deze uitbreiding zijn verder het rank-systeem waarbij sterpiloten hun waarde voor de factie kunnen laten zien, een nieuw gebied genaamd Black Rise, en System Occupancy een nieuwe manier om gebieden over te nemen.